| Archeologický ústav AV ČR Brno, v. v. i. |
| Archeologický ústav, v. v. i. |
| Astronomický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Biologické centrum AV ČR, v. v. i. |
| Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Botanický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Centrum výzkumu globální změny |
| Etnologický ústav, v. v. i. |
| Filosofický ústav, v. v. i. |
| Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Geofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Geologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Historický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Kancelář AV ČR |
| Knihovna AV ČR, v. v. i. |
| Masarykův ústav a Archiv AV ČR, v. v. i. |
| Matematický ústav AV ČR, v. v .i. |
| Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Národohospodářský ústav AV ČR, v. v. i. |
| Orientální ústav AV ČR, v. v. i. |
| Psychologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Slovanský ústav AV ČR, v. v. i. |
| Sociologický ústav AV ČR, v.v.i. |
| Středisko společných činností AV ČR, v. v. i. |
| Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i. |
| Ústav anorganické chemie AV ČR, v. v. i. |
| Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i. |
| Ústav dějin umění, v. v. i. |
| Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i. |
| Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského AV ČR, v. v. i. |
| Ústav fyziky atmosféry AV ČR, v. v. i. |
| Ústav fyziky materiálů AV ČR, v. v. i. |
| Ústav fyziky plazmatu AV ČR, v. v. i. |
| Ústav geoniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i. |
| Ústav informatiky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav jaderné fyziky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav makromolekulární chemie AV ČR, v. v. i. |
| Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Ústav pro českou literaturu AV ČR, v. v. i. |
| Ústav pro hydrodynamiku AV ČR, v. v. i. |
| Ústav pro jazyk český AV ČR, v. v. i. |
| Ústav pro soudobé dějiny AV ČR, v. v. i. |
| Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav státu a práva, v. v. i. |
| Ústav struktury a mechaniky hornin, v. v. i. |
| Ústav teoretické a aplikované mechaniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v. v. i. |
| Ústav termomechaniky AV ČR, v. v. i. |
| Ústav výzkumu globální změny AV ČR, v. v. i. |
| Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i. |